LncRNA 測(cè)序
長(zhǎng)鏈非編碼RNA (long non-coding RNA) 是一類長(zhǎng)度大于 200nt,且不編碼蛋白質(zhì)的 RNA,廣泛存在于生物體內(nèi)。Lnc-RNA 測(cè)序采用去除 rRNA 的建庫(kù)方法,并依托高通量測(cè)序技術(shù),一次性獲得單堿基分辨率的特定組織或細(xì)胞在特定階段的所有 mRNA 和lncRNA,研究 lncRNA 在轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等方面對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控作用。
技術(shù)路線
送樣建議
濃度(Qubit) |
體積 |
總量 |
基因組完整性 |
≥200ng/μL |
≥25μL |
≥5μg |
RNA 無(wú)降解, 無(wú)基因組污染,無(wú)蛋白和雜質(zhì)污染,OD260/280≥1.8,23S/16S≥1,RIN≥7 |
技術(shù)參數(shù)
LncRNA 測(cè)序 |
測(cè)序策略 |
數(shù)據(jù)量 |
周期 |
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HiSeq4000 PE150 |
6~10Gb data |
45個(gè)自然日 |
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