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微生物多樣性/擴(kuò)增子測(cè)序
微生物擴(kuò)增子測(cè)序主要通過直接擴(kuò)增環(huán)境總 DNA 的特定區(qū)域，繞過微生物培養(yǎng)瓶頸，****評(píng)估多樣品環(huán)境微生物分布、豐度變化和群落組成情況。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，微生物擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)已成為環(huán)境微生物群落比較和差異分析的主流研究手段之一。
針對(duì)不同研究需求，一般選擇擴(kuò)增 16S 高變區(qū)來區(qū)分環(huán)境樣品的細(xì)菌和古菌群落，ITS 區(qū)域擴(kuò)增用以評(píng)估真菌群落，原生動(dòng)物等為主的真核微生物群落研究可通過 18S 高變區(qū)測(cè)序來實(shí)現(xiàn) 。此外，也可通過特定的功能基因測(cè)序等來揭示特定功能相關(guān)的環(huán)境微生物群落分布。
信諾金達(dá)擁有標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)流程，經(jīng)驗(yàn)豐富的生產(chǎn)研發(fā)人員、專業(yè)的信息分析團(tuán)隊(duì)、領(lǐng)跑國際的交付周期和****的客戶服務(wù)，結(jié)合專注環(huán)境微生物研究的 Illumina MiSeq 測(cè)序技術(shù)，始終為微生物群落研究提供****和****的測(cè)序服務(wù)。
技術(shù)路線
送樣建議
| 濃度(Qubit) |
體積 |
總量 |
基因組完整性 |
| ≥20ng/μL |
≥15ng/μL |
≥0.3μg |
DNA無降解 |
技術(shù)參數(shù)
| 測(cè)序平臺(tái) |
測(cè)序策略 |
數(shù)據(jù)量 |
周期 |
| Illumina MiSeq |
PE300 |
20,000 raw tags |
30個(gè)自然日 |
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