真核轉錄組測序
轉錄組即特定組織或細胞在某一功能狀態下所有轉錄本的總和,包括 mRNA 和非編碼 RNA(即Non-coding RNA,如 tRNA,rRNAs,microRNAs,piRNAs 和 long ncRNAs 等)。轉錄組測序 (Transcriptome sequencing) 主要指通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的。mRNA,可以用來研究基因結構和基因定量分析,并預測新轉錄本,是深入研究轉錄組復雜性的強大手段和工具。目前,轉錄組測序已經被廣泛應用于動植物發育階段的研究、優良品種基因的篩選和疾病治療等。
技術路線
送樣建議
物種 |
濃度(Qubit) |
體積 |
總量 |
基因組完整性 |
真菌 total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;圖譜基線無上抬,5S?峰正常
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其他動、植物total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;圖譜基線無上抬,5S?峰正常
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原核 total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;圖譜基線無上抬,5S?峰正常
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技術參數
有參轉錄組測序 |
測序策略 |
數據量 |
周期 |
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HiSeq4000 PE150 |
6G clean date |
45個自然日 |
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